生理学研究所は，大学共同利用機関として，人体の生命活動の総合的な解明を究極の目標とし，分子から個体のレベルにわたり，人体等高等動物の機能の総合的な研究を行うことを目的としている。
本研究所は，これらに関連する分野における研究者との共同研究等を実施するとともに，研究者の養成に関しては，国，公，私立大学の要請に応じて，「特別研究学生」を受け入れ，大学院における教育に協力を行ってきたが，近年における，研究所の研究活動への大学院学生の参画の重要性に鑑み，平成９年度からは当該大学院生を「特別共同利用研究員」として受け入れ，併せて研究指導を行い大学院教育の協力を行うこととした。
受入れ対象は，生理学及び関連分野を専攻する大学院在学者で，受入れ期間は原則として一年で，各大学の大学院から推薦された者について，審査委員会において審査ののち，所長が受入れを決定する。
