生理学研究所に超高圧電子顕微鏡（H-1250M型）が、１９８２（昭和５７）年３月に導入されている。生理学研究所の超高圧電子顕微鏡は、1、 000kV級の装置で、医学生物学用に特化した装置として我が国唯一であるので、設置当初より全国に課題を公募して共同利用実験を行ってきた。最近は「生 体微細構造の三次元解析」「生物試料の高分解能観察」「生物試料の自然状態における観察」の３つのテーマを設定している。設置以来の生理学研究所の超高圧 電子顕微鏡の平均稼働率は、約80%に達している。全利用日数の約半分を所外からの研究者が使用しており、1、000kV級超高圧電子顕微鏡の医学生物学 領域における日本でのセンター的役割を果たしてきた。２０年度も、１３課題が採択され、所外６６日、所内６５日の利用があった。